โรงเรียนวัดดินดอน จัดตั้งขึ้นเป็นโรงเรียนวัดครั้งแรกในปี พ.ศ. 2489 โดยพระปลัดเกลี้ยง       เจ้าอาวาสวัดดินดอน และได้ใช้ศาลาธรรมเป็นที่เรียน
          ต่อมาทางราชการได้จัดเป็นโรงเรียนประชาบาล สอนตามหลักสูตรของกระทรวงธรรมมาการ       มีนักเรียน 30 คน โดยมี นายปลื้ม ดวงมาศ เป็นครูใหญ่
          พ.ศ. 2477  เจ้าอาวาสวัดดินดอน พร้อมด้วยคณะครู และประชาชน ได้ร่วมกันจัดสร้างอาคารเรียนติดกับ ศาลาธรรมอีกหลังหนึ่ง กว้าง 6 เมตร ยาว 10 เมตร ใช้เป็นที่เรียนคู่กับศาลาธรรมเรื่อยมาเป็นเวลา 20 ปี มีจำนวนนักเรียนเพิ่มขึ้น
          ต่อมา พ.ศ.2528 ได้ขยายชั้นเรียนจนถึง ชั้นประถมศึกษาปีที่ 7 นักเรียน 413 คน และมีแนวโน้มนักเรียนเพิ่มขึ้น ต่อมามีการใช้หลักสูตร 2551 เหลือเพียง ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 – 6 และประกอบกับโรงเรียนที่อยู่ใกล้เคียงได้เปิดชั้นเรียนด้วย  นักเรียนจึงต้องถูกแบ่งไปตามความสะดวกในการเดินทางของนักเรียน โรงเรียนได้มีการพัฒนาและเปลี่ยนแปลงเรื่อยมาตามลำดับ ที่ดินส่วนหนึ่งเป็นของวัดและอีกส่วนหนึ่งนายจิตร ฆังคะ ได้บริจาคให้โรงเรียน